Biaya Sewa Mahal
Karena stadion JIS adalah stadion yang cukup baru di Indonesia disebut biaya sewa stadion sangat mahal. Mungkin biaya sewa stadion JIS lebih mahal dibandingkan Gelora Bung Karno. Bahkan klub Persija Jakarta memilih untuk main di Bekasi dibandingkan menyewa stadion JIS yang biayanya membutuhkan dana besar.
Tidak Punya Area Khusus
FIFA pernah membuat rekomendasi soal stadion JIS yang kurang memiliki area khusus untuk masuk dan keluar tim ofisial, pemain dari menuju stadion. Hal itu sangat menjadi catatan penting karena tidak mungkin akses pemain dan ofisial tim sama-sama menggunakan pintu yang sama.
Pagar Pembatas
Stadion JIS pernah disorot ketika pagar pembatas stadion ada yang ambruk karena tak kuat menahan banyak penonton yang berdiri. Pagar pembatas untuk membatasi kelompok suporter satu dan lainnya harus diperbanyak guna menghindari terjadinya kericuhan.