Penjara Mabes Polri adalah tempat khusus bagi tahanan yang proses hukumnya diproses penyidik Bareskrim Mabes Polri. Banyak tahanan dari kasus-kasus besar yang mendekam di penjara Mabes Polri. Dilansir dari Detikcom, penjara di Mabes Polri tidak ada fasilitas seperti kulkas, TV.
Di dalam penjara Mabes Polri hanya ada kasur dan kamar mandi. Setiap kamar memiliki pintu yang terbuat dari besi dengan papan nama penghuni kamar. Bareskrim Mabes Polri menyediakan ruangan hiburan untuk para tahanan, termasuk mungkin pernah dipakai oleh Ustaz Yahya Waloni.