Sayangnya saat Megawati sedang mengandung Prananda, suaminya mengalami kecelakaan pesawat dan meninggal dunia ketika sedang melakukan misi di Irian Jaya pada 22 Januari 1970. Kepergian suaminya saat Megawati sedang hamil anak kedua adalah sebuah kesedihan.
Megawati lalu menikah dengan Taufiq pada tahun 1973. Pernikahan mereka terjadi pada Maret 1973. Megawati dan Taufiq sudah lama kenal ketika masih sama-sama jadi aktivitas di Gerakan Mahasiswa Nasional Indonesia atau GMNI. Taufiq dan Megawati dikenal sebagai pasangan yang harmonis sampai maut memisahkan mereka berdua.