Usaha untuk merebut Indonesia lagi dilakukan Belanda lewat dua cara. Melalui perjanjian dan agresi militer. Antara tahun 1940 hingga 1949, terjadi dua kali agresi militer tahun 1947 dan 1948. Juga penandatanganan perjanjian Linggarjati hingga Konferensi Meja Bundar.
Pertemuan itu kemudian melahirkan kesepakatan untuk membentuk Panitia Pendirian dan Dewan Kurator Balai Perguruan Tinggi. Setelah mengadakan rapat kecil dan besar, Balai Perguruan Tinggi Gadjah Mada berdiri pada tanggal 3 Maret 1946.
Selain Balai Perguruan Tinggi Gadjah Mada, tujuh perguruan tinggi lain yang terletak di Yogyakarta, Klaten, dan Surakarta juga beroperasi dalam kurun waktu tahun 1946-1948. Karena situasi yang gak kondusif semua bergabung jadi satu. Hingga resmi Universitas Gadjah Mada didirikan di Yogyakarta.
Fakultas dan Program Studi UGM
Berikut ini adalah fakultas-fakultas dan program studi di Universitas Gadjah Mada:
1. Fakultas Biologi
2. Fakultas Ekonomika dan Bisni
3. Fakultas Farmasi
4. Fakultas Filsafat
5. Fakultas Geografi
6. Fakultas Hukum
7. Fakultas Ilmu Budaya
8. Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik
9. Fakultas Kedokteran
10. Fakultas Kedokteran Gigi
11. Fakultas Kedokteran Hewan
12. Fakultas Kehutanan
13. Fakultas MIPA (Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam)
14. Fakultas Pertanian
15. Fakultas Peternakan
16. Fakultas Psikologi
17. Fakultas Teknik
18. Fakultas Teknologi Pertanian
19. Sekolah Vokasi
20. Sekolah PAscasarjana
Pusat Studi UGM
Pusat Studi UGM memiliki 28 Pusat Studi yan memiliki tugas utama melakukan kegiatan penelitian untuk mendukung kegiatan pendidikan dan pengabdian masyarakat. Pusat-pusat studi tersebut adalah:
PS Sumber Daya Lahan
PS Pengendalian Hayati
PS Pedesaan dan Kawasan
PS Transportasi dan Logistik
PS Kependudukan dan Kebijakan
PS Keamaanan dan Perdamaian
PS Bencana
PS Pariwisata
PS Lingkungan Hidup
PS Kebudayaan
PS Korea
PS Pangan dan Gizi
PS Ilmu Teknik
PS Farmakologi Klinik dan Kebijakan Obat
PS Sosial Asia Tenggara
PS Perdagangan Dunia
PS Argoekologi
PS Pancasila
PS Wanita
PS Ekonomi dan Kebijakan Publik
PS Jerman
PS Bioteknologi
PS Ekonomi Kerakyatan
PS Sumderdaya dan Teknologi Kelautan
PS Energi
PS Perencanaan Pembangunan Regional
PS Asia Pasifik
PS Jepang
PS Kependudukan dan Kebijakan