Masa inkubasi atau interval dari infeksi hingga timbul gejala berkisar 2 hingga 21 hari. Berikut ini gejala awal dari virus Marburg:
1. Demam tinggi
2. Sakit kepala parah
3. Kelelahan parah
4. Sakit dan nyeri otot
5. Diare cair yang parah
6. Sakit perut dan kram
7. Mual dan muntah