Kejaksaan menyelesaikan presentasi Sidang Slobodan Milosevic 25 Februari 2004, setelah persidangan terhadap hampir 300 saksi.
Pada 31 Agustus, fase berikutnya dari persidangan dimulai. Saat itulah giliran Milosevic untuk menghadirkan pembelaannya, yang untuknya ia diberikan 150 hari. Ratusan saksi sudah diumumkan.
Keadaan kesehatan yang buruk (masalah jantung, tekanan darah tinggi, serangan kelelahan) dari terdakwa menyebabkan banyak penundaan dalam kemajuan persidangan.
Pada 11 Maret 2006, ICTY mengumumkan bahwa Slobodan Milosevic ditemukan tewas di selnya.
Pada 14 Maret 2006, proses terhadap Sidang Slobodan Milosevic secara resmi dihentikan.