Akibatnya, keputusan dibuat pada bulan November atau Desember untuk beralih ke pembunuhan sistematis dan terorganisir dalam skala industri. Ngeri banget gengs hasil dari konferensi Wannsee di Berlin.
Musim panas 1941, Rudolf Höss, komandan kamp konsentrasi Auschwitz-Birkenau menerima perintah untuk mengeksplorasi metode baru pembunuhan massal menggunakan gas beracun. Jerman telah menggunakan gas dalam Program Euthanasia dan telah membunuh puluhan ribu orang cacat fisik dan mental.
Eksperimen pertama dengan pembunuhan massal dengan gas dilakukan di Auschwitz pada September 1941. Para korban percobaan adalah tahanan perang Soviet. Jerman memompa Zyklon B, gas sianik, ke ruang tertutup dan dalam beberapa menit para korban semuanya terbunuh.